甲硝唑芬布芬胶囊对于治疗细菌性口腔溃疡有较好的疗效，但对复发性阿弗他溃疡无效。
甲硝唑芬布芬胶囊中甲硝唑为抗生素，能抑制细菌生长，减少细菌产生的毒素，减轻炎症反应；芬布芬为非甾体抗炎药，具有镇痛、消炎的作用，因此可以有效控制细菌性口腔溃疡的发展。而复发性阿弗他溃疡多与遗传、精神紧张等因素有关，此时服用甲硝唑芬布芬胶囊并不能起到明显的治疗效果。
在使用甲硝唑芬布芬胶囊时，应监测肝功能，避免长期大量使用以减少潜在风险。
针对口腔溃疡的治疗需个体化考虑，在使用甲硝唑芬布芬胶囊的同时，可配合口腔护理措施，如定期漱口、避免刺激性食物等，以促进愈合。
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